دستگاه ژل داک Gel Imaging InGenius3

دستگاه ژل داک که به عنوان سیستم مستندسازی ژل، سیستم تصویر برداری از ژل شناخته می شود و جز تجهیزاتی است که در آزمایشگاه های زیست شناسی مولکولی برای تصویربرداری و مستندسازی اسید نوکلئیک و پروتئین معلق در ژل های پلی آکریل آمید یا آگارز استفاده می شود. روش های الکتروفورز ژل پلی آکریل آمید یا آگارز برای بررسی اسیدهای نوکلئیک یا پروتئین ها به منظور تجزیه و تحلیل داده های ژنتیکی انجام می شود. برای آنالیز پروتئین، از الکتروفورز ژل دو بعدی (2-DGE) استفاده می شود که یکی از روش هایی است که اغلب در تحقیقات پروتئومی مقایسه ای استفاده می شود که می تواند هزاران پروتئین را در یک اجرا متمایز کند.

پروتئین ها ابتدا با استفاده از 2-DGE بر اساس نقاط ایزوالکتریک (pIs) آنها در یک بعد و سپس بر اساس جرم مولکولی آنها در بعد دیگر جدا می شوند. پس از آن، تجزیه و تحلیل کمی و کیفی کامل پروتئوم‌ها با استفاده از دستگاه ژل داک با روش‌های ارزیابی تصویر نرم‌افزاری روی ژل‌های 2-DGE رنگ‌آمیزی شده برای مشاهده پروتئین انجام می‌شود. ژل ها معمولاً با اتیدیوم بروماید یا سایر لکه های اسید نوکلئیک مانند GelGreen رنگ آمیزی می شوند.

به طور کلی، دستگاه ژلداک شامل یک نور فرابنفش (UV)، یک هود یا یک اتاق تاریک برای محافظت از منابع نور خارجی و محافظت از کاربر در برابر قرار گرفتن در معرض اشعه ماوراء بنفش، یک کامپیوتر، نرم افزار و یک دوربین CCD با کارایی بالا برای گرفتن عکس است. با توجه به سنسور نوری مورد استفاده در سیستم های ژلداک کیفیت عکس با اندازه سنسور تصویر افزایش می یابد.

باندهای پروتئینی متراکم بسیار درخشان هستند و به نوردهی مختصری در تصویربرداری های فلورسانس نیاز دارند برعکس باندهای پروتئینی با چگالی کم.

اتیدیوم بروماید (EtBr) رایج ترین معرف مورد استفاده برای رنگ آمیزی DNA در ژل آگارز است. هنگامی که اتیدیوم بروماید در معرض نور فرابنفش قرار می گیرند، الکترون های موجود در حلقه مولکول اتیدیوم فعال می شوند، که منجر به آزاد شدن انرژی (نور) با بازگشت الکترون ها به حالت پایه می شود.

علاوه بر این، EtBr یک زباله خطرناک در نظر گرفته می شود و باید به طور مناسب دفع شود. رنگ‌های جایگزین برای DNA در ژل‌های آگارز عبارتند از SYBR Gold، SYBR green، Crystal Violet و Methyl Blue.